蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究離不開雙向電泳，無論你喜歡與否。但雙向電泳中的不確定性卻一直困擾著研究人員，讓人頗為煩惱。通用電氣醫(yī)療集團(tuán)的生命科學(xué)部擁有著市場上多的雙向電泳用戶，無疑也就有了豐富的疑難排解經(jīng)驗。據(jù)介紹，其實絕大部分問題源自于實驗結(jié)果中不可控的系統(tǒng)誤差。怎么辦?可不能讓這些系統(tǒng)誤差扼殺了我們的研究成果。
為了解決這些問題，通用電氣醫(yī)療集團(tuán)生命科學(xué)部推出了一系列用于改進(jìn)和簡化整個雙向電泳工作流程的新產(chǎn)品，其中包括了從樣品制備，到雙向電泳本身，再到結(jié)果分析，尤其強(qiáng)化了蛋白表達(dá)研究的定量。這些簡單易用的產(chǎn)品極大地改善了雙向電泳實驗的數(shù)據(jù)質(zhì)量，同時縮減了在蛋白表達(dá)分析方面的費(fèi)用支出并節(jié)省了大量時間----采用2-D DIGE至少可以節(jié)省3倍的費(fèi)用和6倍的時間!
在樣品制備方面，一系列樣品制備試劑盒已正式推出?？蓜e小看了樣品制備，要想在雙向電泳中獲得高質(zhì)量的結(jié)果，細(xì)胞裂解和蛋白抽提那可是關(guān)鍵。新上市的2D蛋白抽提體驗試劑盒含6種不同配方，便于用戶篩選合適的樣品抽提緩沖液。這6種蛋白抽提緩沖液皆源自對可靠而有效的蛋白抽提緩沖液的升級改良，以求進(jìn)一步提高2D凝膠分析中的點(diǎn)分辨率。而哺乳動物細(xì)胞蛋白抽提液采用溫和的去垢劑，可以用于貼壁細(xì)胞和懸浮細(xì)胞的蛋白抽提;酵母蛋白抽提試劑盒無需玻璃珠，采用酶法溫和抽提酵母細(xì)胞可溶性蛋白，抽提的蛋白可保持生物活性。
在雙向電泳方面，新品輩出啊。首先是IPG膠條改良了，穩(wěn)定性、重復(fù)性和蛋白點(diǎn)清晰度更佳。IPG緩沖液的配方同時也改進(jìn)了。另外，還要?dú)g迎Ettan 2D系統(tǒng)中的兩個新成員：IPGbox? 和IPGbox Kit。 IPGbox的設(shè)計經(jīng)過改進(jìn)，底座和上蓋可以分離，更加友好和穩(wěn)定，且不透明的蓋子讓水化在暗處進(jìn)行，完全適合光敏感的CyDye DIGE熒光染料。上蓋和插片的設(shè)計可保證膠條在水化過程中不會變干，無需再用覆蓋油，你再也不用為油而煩惱了。同時一次性使用的水化盤和插片，也保證樣品之間沒有交叉污染。水化盤經(jīng)過重新設(shè)計后，高疏水性材料保證溶漲液不會粘附在盤上，且水化液均勻分布在整個盤內(nèi)，確保IPG膠條水化的一致性。
為了進(jìn)一步簡化DIGE實驗流程，減少系統(tǒng)誤差，提高定量準(zhǔn)確性，通用電氣醫(yī)療集團(tuán)生命科學(xué)部還推出了DIGE預(yù)制膠及DIGE膠電泳緩沖液。 DIGE預(yù)制膠為12.5%膠濃度的低熒光凝膠，灌制在低熒光玻璃板中間，厚度為1mm，面積為25×20cm。DIGE預(yù)制膠采用PPA緩沖體系。配合相應(yīng)電泳緩沖液，DIGE預(yù)制膠可以為用戶呈獻(xiàn)高分辨率、高重復(fù)性的結(jié)果。此外，CyDye DIGE熒光染料也換了新包裝，分別用于飽和標(biāo)記和小標(biāo)記，更加適合實驗設(shè)計。
實驗是前提，后面的數(shù)據(jù)分析則更為關(guān)鍵。新版的DeCyder 2D軟件是Ettan DIGE平臺中的核心部分，DIGE獨(dú)特的內(nèi)標(biāo)和實驗設(shè)計均精巧地體現(xiàn)其中，使得DIGE技術(shù)能夠為用戶檢測到微小的差異表達(dá)信息并得到準(zhǔn)確的定量結(jié)果。其自動化的軟件設(shè)計，極大地減少了用戶手工操作的時間，保證了不同用戶、實驗室之間結(jié)果的重復(fù)性和可比性。而膠內(nèi)采用共找點(diǎn)的檢測方式，極大地提高了結(jié)果的準(zhǔn)確率，避免了錯誤匹配。DeCyder軟件仍然采用Oracle作為數(shù)據(jù)庫基礎(chǔ)，保證數(shù)據(jù)交換的順暢和數(shù)據(jù)的**。同時有了較大程度的改進(jìn)，界面更加友好，安裝更加簡單;軟件中增加了圖像編輯的功能;膠間匹配時增加了“warping”功能，進(jìn)一步提高了匹配的準(zhǔn)確性;增加了更多手工編輯的功能;值得提及的是，在新版DeCyder軟件中，EDA模塊作為標(biāo)準(zhǔn)配置添加在DeCyder 2D中，無需額外負(fù)擔(dān)任何費(fèi)用，即可完成多因素的統(tǒng)計分析，尋找分子標(biāo)志物!
對于流程復(fù)雜、對技術(shù)要求高的蛋白質(zhì)組研究而言，通用電氣醫(yī)療集團(tuán)所提供的整體解決方案能讓工作事半功倍。你無需考慮產(chǎn)品的兼容問題，更專注于實驗和結(jié)果分析本身。而這些新產(chǎn)品在大限度地減少系統(tǒng)誤差的同時，也將為你帶來**性的雙向電泳新體驗。
有了這么多利器在手，你再何懼雙向電泳?
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