PyroMark Q24 焦磷酸測序儀采用成熟的焦磷酸測序技術(shù),在遺傳分析和表觀遺傳的甲基化研究中進行基于序列的實時檢測和定量,獨特的PyroMark系統(tǒng)僅需數(shù)分鐘即可提供可靠的定量和測序結(jié)果。PyroMark Q24是集測序、樣品制備、試劑和對照以及完整和靈活的軟件于一體的系統(tǒng),非常適用于二、三和四等位基因突變以及連續(xù)CpG位點分析及定量。相比于Sanger測序需在測序前進行耗時的PCR產(chǎn)物克隆,PyroMark Q24則在15分鐘的時間內(nèi)可完成1-24個樣品的序列分析及高度準(zhǔn)確的定量。
原理和功能:
1、PyroMark Q24 序列分析儀:利用亞硫酸氫鹽法和焦磷酸測序——其原理是根據(jù)所有未甲基化的C經(jīng)亞硫酸氫鹽處理和PCR之后全部轉(zhuǎn)化成T,然后通過焦磷酸測序,對比處理和未處理的PCR產(chǎn)物來確定DNA的甲基化情況。PyroMark Q24在甲基化試驗中能**定量單個CpG位點,能夠在混合的細胞群體中定量常見和稀有突變以及等位基因頻率,且甲基化分析和SNP分型可整合在一次實驗中完成。
2、PyroMark Q24 真空工作站:用于制備單鏈DNA——從PCR產(chǎn)物到測序即用的單鏈模板,利用PyroMark Q24真空工作站可在15分鐘內(nèi)平行處理多至24個樣品且可靠的流程有助于避免樣品批次間的DNA交叉污染。在工作站中生物素標(biāo)記的PCR產(chǎn)物與鏈霉素親和素包被的樹脂微珠相結(jié)合,微珠隨后被Vavuum Prep Tool捕獲并徹底清洗,產(chǎn)生適合測序的單鏈DNA。
3.PyroMark Q24 軟件:安裝在PC上的此款軟件可對同一塊板上的樣品采用兩種模式進行分析——CpG和AQ(等位基因定量),AQ模式可分析單個和多變位點以及二重、三重和四重等位基因突變,CpG模式可分析多個連續(xù)的CpG位點并提供了亞硫酸氫鹽處理的內(nèi)置參照。利用設(shè)計軟件可以對引物進行設(shè)計,使其中一條引物帶上生物素標(biāo)記以利于生成的PCR產(chǎn)物在樣品制備時被固定在微珠上。此外,軟件還提供了參考序列模式,給出包括預(yù)計峰位置和預(yù)計峰高度的信息,運行之后,根據(jù)此信息對單個位點以及序列背景進行質(zhì)量評估。
產(chǎn)品應(yīng)用:
通過亞硫酸氫鹽處理和焦磷酸測序進行甲基化程度和等位基因頻率分析,發(fā)現(xiàn)稀有突變和CpG位點以及SNP分型,是表觀遺傳學(xué)和癌癥研究的有力工具。
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